সার্জারির চকোলেট এলার্জি সম্ভব এমনকি যদি তারা হয় বিরল. এই ক্ষেত্রে অ্যালার্জির ঘটনাটি কোকোর প্রোটিন থেকে আসে। অ্যালার্জিযুক্ত ব্যক্তি যে এটি সেবন করে তখন শ্বাস নিতে অসুবিধা হয়, তার মাথাব্যথা, ফুসকুড়ি, টাকাইকার্ডিয়া, চুলকানি এবং পেটে জ্বালাপোড়া হয়।

এই উপসর্গগুলি এমন লোকেদের মধ্যেও লক্ষ্য করা যায় যারা চকলেট তৈরির উপাদানগুলির প্রতি অ্যালার্জিযুক্ত (বাদাম, দুধ প্রোটিন, ইত্যাদি.), যদিও তারা তাই প্রকৃতপক্ষে কোকো থেকে অ্যালার্জি নয়।